原位杂交实验流程及实验原理
一、原位杂交实验流程
原位杂交实验(In Situ Hybridization, ISH)是一种在细胞或组织切片中检测特定核酸序列的技术。以下是原位杂交实验的一般流程:
1. 样品制备:获取待检测的样品,可以是细胞、组织切片、细胞核或染色体等。样品需要进行固定、脱水和包埋等处理,以保持其形态结构。
2. 固定:固定样品的目的是保持样品的原有形态学,常用的固定方法有甲醛固定、丙酮固定等。
3. 脱水和透明化:固定完样品后,需要对其进行脱水处理,通常采用浓度递增的乙醇溶液进行,如70%、85%和95%乙醇溶液。随后进行透明化,使用二甲苯等溶剂。
4. 包埋和切片:脱水和透明化后的样品需要包埋,常用的包埋材料有石蜡或树脂。包埋后的样品在切片机上切成薄片,用于后续的杂交实验。
5. 预杂交处理:包括细胞通透化,使探针或抗体能够透过细胞,以及使用蛋白酶K等酶处理以增加探针的渗透性。
6. 探针制备:合成RNA或DNA探针,这些探针是一段标记有荧光染料或生物素、地高辛等标记物的核酸序列,用于与待检测样品中的靶标核酸进行互补配对。
7. 杂交:将制备好的探针与样品中的核酸进行杂交,通常在特定的温度和湿度条件下进行过夜。
8. 杂交后洗涤:杂交完成后,需要在不同的缓冲液中洗涤样品,以去除未结合的探针。
9. 显色检测:使用特定的方法(如**细胞化学方法)对标记探针进行探测,从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。
10. 观察和分析:*后,在显微镜下观察杂交结果,并进行图像分析和数据解释。
二、原位杂交实验原理
原位杂交技术基于核酸分子单链之间有互补的碱基序列,将有放射性或非放射性的外源核酸(即探针)与组织、细胞或染色体上待测DNA或RNA互补配对,结合成专一的核酸杂交分子,经一定的检测手段将待测核酸在组织、细胞或染色体上的位置显示出来。
1. 核酸的互补配对:原位杂交的本质是在一定的温度和离子浓度下,使具有特异序列的单链探针通过碱基互补规则与组织细胞内待测的核酸复性结合而使得组织细胞中的特异性核酸得到定位。
2. 探针的标记:探针的种类按所带标记物可分为同位素标记探针和非同位素标记探针两大类。目前,大多数放射性标记法是通过酶促反应将标记的基因掺入DNA中,常用的同位素标记物有3H、35S、125I和32P。非同位素标记物中目前*常用的有生物素、地高辛和荧光素三种。
3. 杂交分子的形成:杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。
4. 检测系统:通过探针上所标记的检测系统将其在核酸的原有位置上显示出来。例如,荧光原位杂交(FISH)技术中,探针首先与某种介导分子(reporter molecule)结合,杂交后再通过**细胞化学过程连接上荧光染料。
5. RNA原位杂交:RNA原位杂交技术是指运用cRNA或寡核苷酸等探针检测细胞和组织内RNA表达的一种原位杂交技术。其基本原理是:在细胞或组织结构保持不变的条件下,用标记的已知的RNA核苷酸片段,按核酸杂交中碱基配对原则,与待测细胞或组织中相应的基因片段相结合(杂交),所形成的杂交体(Hybrids)经显色反应后在光学显微镜或电子显微镜下观察其细胞内相应的mRNA、rRNA和tRNA分子。
通过上述流程和原理,原位杂交技术能够在细胞或组织水平上对特定的核酸序列进行**的定位和定量分析,为分子生物学、遗传学、病理学等领域的研究提供了强有力的工具。
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